Rubén Hoguera, de Izquierda Independiente, asegura que se trata de un proyecto también desaconsejado por el CSIC por las consecuencias que tendría sobre la flora, la fauna y los espacios naturales. Por ellos las alegaciones serán presentadas al nuevo Consejero de Transportes de la Comunidad de Madrid, José Ignacio Echevarría. «Esperemos que la respuesta del Consejero sea la paralización de este proyecto de cierre de la M-50. Esta es una M-50 que no queremos», asegura Holguera.
Las alegaciones denuncian la destrucción de miles de metros cuadrados de parques y encinares así como el incremento del ruido y contaminación en la zona. Si se pusiesen todas las alegaciones en fila sumarían 2,6 kilómetros, una longitud mayor incluso que los 2,4 km de falsos túneles que prevé construir la Comunidad de Madrid.